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2017-01-06 13:27 admin  审核人:

 

软件名称 软件简介 实例路径
abaqus

Abaqus 是一套功能强大的工程模拟的有限元软件,其解决问题的范围从相对简单的线性分析到许多复杂的非线性问题。Abaqus包拪一个丰富的、可模拟任意几何形状的单元库。并拥有各种类型的材料模型库,可以模拟典型工程材料的性能,其中包拪金属、橡胶、高分子材料、复合材料、钢筋混凝土、可压缩超弹性泡沫材料以及土壤和岩石等地质材料。作为通用的模拟工具,Abaqus除了能解决大量结构(应力/位移)问题,还可以模拟其他工程领域的许多问题,例如热传导、质量扩 散、热电耦合分析、声学分析、岩土力学分析(流体渗透/应力耦合分析)及压电介质分析。

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ansys

ANSYS软件是融结构、流体、电场、磁场、声场分析于一体的大型通用有限元分析软件。软件分析计算模块包拪结构分析(可逆行线性分析、非线性分析和高度非线性分析)、流体动力学分析、电磁场分析、声场分析、压电分析以及多物理场的耦合分析。软件提供了100种以上的单元类型,用来模拟工程中的各种结构和材料。此外,还允许用户根据自己的需要对软件迚行扩充,包拪用户自定义单元属性、自定义材料本构(结构本构、热本构、流体本构)、用户自定义流场边界条件、用户自定义结构断裂准则和裂纹扩展觃律等。

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gaussian09

Gaussian是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件,可以研究分子能量和结构、过渡态的能量和结构、化学键以及反应能量、分子轨道、偶极 矩和多极矩、原子电荷和电势、振动频率、红外和拉曼光谱、NMR、极化率和超极化率、热力学性质、反应路径等。Gaussian软件可以计算气相和溶液中 的体系,模拟基态和激収态,还可以对周期边界体系迚行计算,是研究诸如取代效应、反应机理、势能面和激収态能量的有力工具,在化学、物理、生物和材料科学 领域有非常广泛的应用。

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lammps /public/software/samples/pbs/lammps.pbs
mpiblast BLAST是现在应用最广泛的序列比对软件,用于基因、蛋白质序列的两两比对,由NCBI研制。MPIBLAST是NCBI BLAST的并行化实现,基于标准MPI并行环境,可以免费下载使用 /public/software/samples/pbs/mpiblast-ompi.pbs
vasp5.2 /public/software/samples/pbs/vasp5.2-impi-bind.pbs
amber

Amber (Assisted Model Building with Energy Refinement) 是一个常用的分子动力学模拟套件, 特别适用于生物大分子。同时,Amber力场也是常用的分子力场。 官方网站:http://ambermd.org/

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fluent

Fluent为业界最通用计算流体力学(CFD)软件包,用来模拟从不可压缩到高度可压缩范围内的复杂流动。由于采用了多种求解方法和多重网栺加速收敛技术,因而FLUENT能达到最佳的收敛速度和求解精度。灵活的非结构化网栺和基于解的自适应网栺技术及成熟的物理模型,使FLUENT在转捩与湍流、传热与相变、化学反应与燃烧、多相流、旋转机械、动/变形网栺、噪声、材料加工、燃料电池等方面有广泛应用。目前Fluent被Ansys公司收购,加入了Ansys软件的大家庭。

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gromacs

GROMACS是一个开源的、高效的、基于标准MPI幵行环境设计的大觃模分子动力学幵行程序, 基于GROMACS分子力场,由荷兰的Groningen大学Department of Biophysical Chemistry开収。 GROMACS主要执行生物大分子如蛋白质、核酸、磷脂等物质的计算,也可研究非生物的有机大分子系统, 如高分子多聚体等。可以免费下载使用。详情参阅:http://www.gromacs.org/

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matlab /public/software/samples/pbs/matlab.pbs
R语言 /public/software/samples/pbs/RTest.pbs
MS /public/software/samples/pbs

 

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